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蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要承擔者。對蛋白質(zhì)進(jìn)行功能聚類(lèi),是理解其參與生理過(guò)程、設計新型蛋白質(zhì)的重要手段?,F有方法主要基于氨基酸一級序列的相似性對蛋白質(zhì)進(jìn)行聚類(lèi)分析,并以此推斷其功能和演化關(guān)系。
“然而,蛋白質(zhì)功能是由其三維空間結構所決定的,開(kāi)發(fā)出基于三維結構的高通量蛋白質(zhì)聚類(lèi)方法,將為蛋白質(zhì)功能研究提供更直接、可靠的手段,并推動(dòng)未知蛋白質(zhì)的功能挖掘?!闭撐耐ㄓ嵶髡?、中科院遺傳發(fā)育所研究員高彩霞介紹。
堿基編輯系統可以實(shí)現DNA或RNA的精準編輯,是基因功能研究、疾病治療、生物育種的變革性技術(shù)?!暗?,現有堿基編輯系統的核心元件——脫氨酶來(lái)源于單一家族,這就導致堿基編輯仍有諸多局限,難以滿(mǎn)足多元化的應用需求?!备卟氏颊f(shuō),正因如此,創(chuàng )新地挖掘新型脫氨酶,開(kāi)發(fā)適用于不同應用場(chǎng)景的新型堿基編輯工具是一項很重要的工作。
此次,研究人員首先通過(guò)人工智能蛋白質(zhì)結構預測模型對具有代表性的脫氨功能序列的蛋白質(zhì)進(jìn)行了批量三維結構預測,隨后創(chuàng )新性地開(kāi)展了基于三維結構的蛋白質(zhì)多重比對與聚類(lèi)?;诰垲?lèi)結果,研究人員開(kāi)發(fā)了一系列新型堿基編輯系統,并在動(dòng)、植物細胞中進(jìn)行了測試。測試結果顯示,新型堿基編輯系統突破了現有脫氨酶的應用瓶頸,在醫學(xué)和農業(yè)方面展現出廣泛的應用前景。
(責任編輯:范曉婷)
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